Alles begann ungefähr 50 Jahren vor der aktuellen Handlung im Anime, als Inuyasha von Kikyou an den heiligen Baum gebannt wurde. Genau in dieser Zeit wurden auch die Katzendämonen aus dem Westen wieder aktiv und überfielen auf der Suche nach dem Shikon no Tama unzählige Dörfer, genau wie sie es schon früher gemacht haben, als Inuyashas Vater noch lebte. Damals schon versuchten die Hyouneko die Herrschaft an sich zu reißen, doch es war Inu-Taishou, der sich ihnen entgegen stellte. Ein erbitterter Kampf zwischen Inu-Taishou und Oyakata (der mächtige Anführer der Hyouneko) entbrannte. Auch Sesshoumaru war damals schon dabei, als die Armee seines Vaters in die Schlacht gegen die Katzen zog.

Inu-Taishou besiegte Oyakata und selbst die Katzendämonen, die unter Oyakatas Kontrolle standen waren ihm für diesen Sieg dankbar. Doch die Katzen schworen, Inu-Taishou und alle seine Verbündeten zu töten. Da Inu-Taishou aber bereits tot war, hatte Sesshoumaru keine andere Wahl, als sich den Katzen alleine zu stellen. Unterstützung bekam er dabei von verschiedenen Youkai, unter anderem auch Ryouyakan. Allerdings versicherten sie Sesshoumaru, dass sie stark wären, was aber nicht der Fall war. Auch Jaken war damals als Sesshoumarus Diener bereits dabei.

Während Sesshoumaru immer mehr Katzen besiegte, wurden die Anderen immer mehr in die Enge getrieben und konnten sich kaum mehr verteidigen. Sie flohen vom Schlachtfeld und wandten sich Hilfe suchend an Sesshoumaru. Unterdessen war Jaken schon unterwegs, um Inuyasha um Hilfe zu bitten, da er immerhin auch ein Sohn von Inu-Taishou ist. Als Jaken ohne Inuyasha zurückkam dachte Sesshoumaru zunächst, dass Inuyasha entweder Angst hat, oder dass er ihm einfach nicht helfen will. Was Sesshoumaru natürlich nicht wissen konnte, ist, dass Inuyasha zu diesem Zeitpunkt bereits an den heiligen Baum gebannt war. Als Jaken Sesshoumaru das erzählte, war dieser verständlicherweise ziemlich wütend, aber erst recht, als Sesshoumaru erfuhr, dass dies nur geschehen konnte, weil Inuyasha sich in einen Menschen verliebte. Vor allem hätte Sesshoumaru Tessaiga gebraucht, mit ihm hätte er die Katzendämonen leicht besiegen können. Letztendlich konnte Sesshoumaru die Katzen in die Flucht schlagen, aber sie nicht besiegen, was Sesshoumarus Stolz empfindlich verletzte.

Natürlich konnte Sesshoumaru Inuyasha nie ganz leiden, was ganz einfach daran liegt, dass Inuyasha kein vollwertiger Youkai ist. Ein Hanyou ist eben nirgends wo angesehen, weder bei den Menschen noch bei den Youkai und so war Inuyasha schon immer ein Außenseiter. Aber es scheint so, als hätte Sesshoumaru noch nie wirklich Probleme damit gehabt, Inuyasha an seiner Seite zu haben, solange er sich wie ein Youkai benahm. Doch die Tatsache, dass Inuyasha sich in einen Menschen verliebt und somit Schwäche gezeigt hat, konnte Sesshoumaru nie akzeptieren. Vor allem deshalb, weil Inuyasha deswegen nicht da war, um Sesshoumaru im Kampf gegen die Katzen zu helfen.

Es ist also nicht so, dass Sesshoumaru Inuyasha grundsätzlich nicht leiden kann, sondern weil Inuyasha ihm im Stich gelassen hat und somit seine ganze Familie verraten hat.